Η ΑΕΚ θα αντιμετωπίσει τη γερμανική Bonn έχοντας το πλεονέκτημα έδρας, ενώ το Περιστέρι θα αντιμετωπίσει στη φάση των «16» τη Hapoel Jerusalem από το Ισραήλ με μειονέκτημα έδρας.
Εφόσον, η «Ένωση» προκριθεί στην επόμενη φάση, θα αντιμετωπίσει το νικητή του ζευγαριού Nymburk-Bandirma ενώ το Περιστέρι εάν προκριθεί θα αντιμετωπίσει το νικητή του ζευγαριού Sassari-Burgos.
Αναλυτικά τα ζευγάρια:
1.Hapoel Jerusalem-Περιστέρι
2. Zaragoza-Lietkabelis
3. Nymburk-Bandirma
4. Turk Telecom-Besiktas
5. Tenerife-Ostande
6. Sassari-Burgos
7. Dijon-Nizhny
8. AEK-Bonn