Η Γωγώ έκανε τα πρώτα της μπασκετικά βήματα στον σύλλογο του ΑΡΗ (1987). Ακολούθησαν ΕΛΠΙΔΑ ΤΟΥΜΠΑΣ, ΕΛΕΥΘ.ΚΟΡΔΕΛΙΟ, ΒΑΟ και ΤΡΙΓΛΙΑ. Τα τελευταία χρόνια αγωνίστηκε στις ομάδες: ΝΑΥΑΡΧΟΣ ΒΟΤΣΗΣ (2012-2013) ΑΠΟΛΛΩΝ ΚΑΛΑΜΑΡΙΑΣ (2013-2014) και ΜΕΝΤ (2014-2016).
Στις πρώτες της δηλώσεις ως αθλήτρια του Ηρακλή στην επίσημη ιστοσελίδα του συλλόγου www.irakliswbc.gr, η Γωγώ Μαργαρίτη τόνισε τα εξής:
«Θερμές ευχαριστίες στον Coach Σίμο Συρόπουλο για την εμπιστοσύνη, δέσμευση για άοκνη προσπάθεια και υψηλές επιδόσεις μέχρι σημείου επίτευξης των στόχων μας ( άνοδος στην Α1). Ευχές για ανεμπόδιστη και αποδοτική συνεργασία. Υγεία πάνω απ’ όλα για μια χρονιά αναίμακτη, χωρίς τραυματισμούς και με τους φιλάθλους στο πλευρό μας».
